Τετάρτη 18 Σεπτεμβρίου 2013. Οι ερευνητές του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας στο Σαν Ντιέγκο στις Ηνωμένες Πολιτείες προτείνουν μια νέα προσέγγιση που ονομάζεται διαστρωμάτωση βάσει δικτύου (NBS) για τον εντοπισμό υποτύπων καρκίνου από τον τρόπο με τον οποίο επηρεάζουν τις μεταλλάξεις τα δίκτυα ή τα γενετικά συστήματα μοιράζονται αντί για τις μοναδικές μεταλλάξεις του κάθε ασθενούς, όπως δημοσιεύθηκε στην προηγμένη ψηφιακή έκδοση της Κυριακής «Nature Methods».
Οι όγκοι του καρκίνου σχεδόν ποτέ δεν μοιράζονται τις ίδιες ακριβείς γενετικές μεταλλάξεις, κάτι που έχει προκαλέσει σύγχυση στις επιστημονικές προσπάθειες για την καλύτερη ταξινόμηση των τύπων καρκίνου και την ανάπτυξη πιο συγκεκριμένων και αποτελεσματικών θεραπειών.
"Η υποτύπου είναι το πιο βασικό βήμα προς την κατεύθυνση του στόχου της εξατομικευμένης ιατρικής", δήλωσε ο επικεφαλής ερευνητής Trey Ideker, επικεφαλής του τμήματος Γενετικής της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας στο Σαν Ντιέγκο και καθηγητής στα τμήματα Ιατρικής και Βιοϊατρικής του ίδιου πανεπιστημιακού κέντρου.
Με βάση τα δεδομένα των ασθενών, οι ασθενείς τοποθετούνται σε υποτύπους με σχετικές θεραπείες. Για παράδειγμα, ένας υποτύπος καρκίνου είναι γνωστό ότι ανταποκρίνεται καλά στο φάρμακο Α, αλλά όχι στο φάρμακο Β. Χωρίς υποτύπους, κάθε ασθενής έχει το ίδιο πτυχή, εξ ορισμού, και δεν γνωρίζουμε πώς να αντιμετωπίζουμε διαφορετικά ", εξήγησε.
Οι πρόσφατες εξελίξεις στη γνώση και την τεχνολογία κατέστησαν ευκολότερη (και λιγότερο δαπανηρή) την αλληλουχία μεμονωμένων γονιδιωμάτων, ειδικά στη θεραπεία του καρκίνου, η οποία είναι βασικά μια ασθένεια των γονιδίων.
Αλλά τα γονίδια είναι "εξαιρετικά ετερογενή", δήλωσε ο Ideker. Τα μεταλλαγμένα γονίδια, επηρεασμένα από άλλους παράγοντες, προκαλούν ασθένειες όπως ο καρκίνος, μια παθολογία που είναι γενετικά μοναδική σε κάθε ασθενή, γεγονός που μπορεί να επηρεάσει την αποτελεσματικότητα και τα αποτελέσματα της κλινικής θεραπείας.
"Όταν εξετάζετε τα δεδομένα ασθενών σε επίπεδο γονιδίων, όλοι φαίνονται διαφορετικοί", δήλωσε ο Ideker. "Αλλά αν κοιτάξετε τα δίκτυα και τα επηρεασμένα βιολογικά συστήματα, φαίνεται να είναι συστάδες. Δεν υπάρχουν μεταλλαγμένα γονίδια στον ίδιο τόπο, αλλά οι μεταλλάξεις εμφανίζονται στα ίδια γενετικά μονοπάτια", δήλωσε ο ειδικός.
Συγκεκριμένα, οι επιστήμονες παρατήρησαν σωματικές μεταλλάξεις που εμφανίζονται σε όγκους, αλλά όχι σε υγιείς ιστούς, σε δεδομένα από ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα, της μήτρας και των ωοθηκών που συνέταξε ο Atlas του Καρκίνου, ένα συνεχές πρόγραμμα των Εθνικών Ινστιτούτων Αμερικανική υγεία για τη συλλογή και καταλογογράφηση των γονιδιωμάτων χιλιάδων ασθενών με καρκίνο.
Ο Ideker είπε ότι η προσέγγιση του NBS έχει άμεση κλινική χρησιμότητα. Η αλληλουχία του γονιδιώματος των ασθενών με καρκίνο γίνεται ταχέως ένα τυποποιημένο μέρος της διάγνωσης, οπότε, σύμφωνα με τον επιστήμονα, οι γιατροί μπορούν να χρησιμοποιήσουν το NBS για να προσαρμόσουν καλύτερα μια θεραπεία με τον καρκίνο υποτύπο και, ανάλογα με τα αποτελέσματα της θεραπείας, Φέρτε τα ευρήματα πίσω στη βάση δεδομένων για να βελτιώσετε και να βελτιώσετε τις θεραπείες του καρκίνου ώστε να είναι όσο το δυνατόν εξατομικευμένες για τα ίδια τα άτομα.
Πηγή:
Ετικέτες:
Ψυχολογία Υγεία Ευεξία
Οι όγκοι του καρκίνου σχεδόν ποτέ δεν μοιράζονται τις ίδιες ακριβείς γενετικές μεταλλάξεις, κάτι που έχει προκαλέσει σύγχυση στις επιστημονικές προσπάθειες για την καλύτερη ταξινόμηση των τύπων καρκίνου και την ανάπτυξη πιο συγκεκριμένων και αποτελεσματικών θεραπειών.
"Η υποτύπου είναι το πιο βασικό βήμα προς την κατεύθυνση του στόχου της εξατομικευμένης ιατρικής", δήλωσε ο επικεφαλής ερευνητής Trey Ideker, επικεφαλής του τμήματος Γενετικής της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας στο Σαν Ντιέγκο και καθηγητής στα τμήματα Ιατρικής και Βιοϊατρικής του ίδιου πανεπιστημιακού κέντρου.
Με βάση τα δεδομένα των ασθενών, οι ασθενείς τοποθετούνται σε υποτύπους με σχετικές θεραπείες. Για παράδειγμα, ένας υποτύπος καρκίνου είναι γνωστό ότι ανταποκρίνεται καλά στο φάρμακο Α, αλλά όχι στο φάρμακο Β. Χωρίς υποτύπους, κάθε ασθενής έχει το ίδιο πτυχή, εξ ορισμού, και δεν γνωρίζουμε πώς να αντιμετωπίζουμε διαφορετικά ", εξήγησε.
Οι πρόσφατες εξελίξεις στη γνώση και την τεχνολογία κατέστησαν ευκολότερη (και λιγότερο δαπανηρή) την αλληλουχία μεμονωμένων γονιδιωμάτων, ειδικά στη θεραπεία του καρκίνου, η οποία είναι βασικά μια ασθένεια των γονιδίων.
Αλλά τα γονίδια είναι "εξαιρετικά ετερογενή", δήλωσε ο Ideker. Τα μεταλλαγμένα γονίδια, επηρεασμένα από άλλους παράγοντες, προκαλούν ασθένειες όπως ο καρκίνος, μια παθολογία που είναι γενετικά μοναδική σε κάθε ασθενή, γεγονός που μπορεί να επηρεάσει την αποτελεσματικότητα και τα αποτελέσματα της κλινικής θεραπείας.
"Όταν εξετάζετε τα δεδομένα ασθενών σε επίπεδο γονιδίων, όλοι φαίνονται διαφορετικοί", δήλωσε ο Ideker. "Αλλά αν κοιτάξετε τα δίκτυα και τα επηρεασμένα βιολογικά συστήματα, φαίνεται να είναι συστάδες. Δεν υπάρχουν μεταλλαγμένα γονίδια στον ίδιο τόπο, αλλά οι μεταλλάξεις εμφανίζονται στα ίδια γενετικά μονοπάτια", δήλωσε ο ειδικός.
Συγκεκριμένα, οι επιστήμονες παρατήρησαν σωματικές μεταλλάξεις που εμφανίζονται σε όγκους, αλλά όχι σε υγιείς ιστούς, σε δεδομένα από ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα, της μήτρας και των ωοθηκών που συνέταξε ο Atlas του Καρκίνου, ένα συνεχές πρόγραμμα των Εθνικών Ινστιτούτων Αμερικανική υγεία για τη συλλογή και καταλογογράφηση των γονιδιωμάτων χιλιάδων ασθενών με καρκίνο.
Ο Ideker είπε ότι η προσέγγιση του NBS έχει άμεση κλινική χρησιμότητα. Η αλληλουχία του γονιδιώματος των ασθενών με καρκίνο γίνεται ταχέως ένα τυποποιημένο μέρος της διάγνωσης, οπότε, σύμφωνα με τον επιστήμονα, οι γιατροί μπορούν να χρησιμοποιήσουν το NBS για να προσαρμόσουν καλύτερα μια θεραπεία με τον καρκίνο υποτύπο και, ανάλογα με τα αποτελέσματα της θεραπείας, Φέρτε τα ευρήματα πίσω στη βάση δεδομένων για να βελτιώσετε και να βελτιώσετε τις θεραπείες του καρκίνου ώστε να είναι όσο το δυνατόν εξατομικευμένες για τα ίδια τα άτομα.
Πηγή: